A inicios de año, el programa recibió el certificado ISO 9001:2008 al Sistema de Gestión de la Calidad (SGC), por parte de la empresa internacional TÜV Rheinland. Posteriormente, se amplió el alcance del SGC ISO 9001:2008 a los procesos de Verificación del Cumplimiento de Corresponsabilidades, Acompañamiento de la Entrega del Incentivo Monetario y Acompañamiento Familiar.

Adicionalmente, se implementaron los requisitos de la norma ISO 9001:2015 a todos los procesos del programa y se capacitó a 30 servidores de la sede central como “auditor interno ISO 9001:2015”.  

En el último tramo del 2016, Juntos puso en funcionamiento el Sistema de Gestión Documental (SGD), un "software" de tecnología de “firma digital” que permite eliminar el papel en la gestión documental y optimizar trámites administrativos en la institución. El programa también cuenta con aplicativos instalados en las tabletas de los gestores, como el Módulo de Afiliación (para incorporar a nuevos usuarios), Módulo de Mantenimiento de Padrón o el Módulo de Verificación del Cumplimiento de las Corresponsabilidades (para verificar si las familias cumplen con llevar a sus hijos al colegio y a los centros de salud).